1、外傷因素：硬糞團通過肛管時，易引起肛管撕裂，尤其是肛門先天性發育不良者，更易受到損傷，在排便時由於大便乾結造成的肛門皮膚破裂。而當腹瀉時，由於排糞的頻繁會使肛管敏感緊縮，正常稠度糞便也可導致肛門部位皮膚的損傷。此外，產傷也可致肛裂，約佔3％～9％。腹瀉時頻繁排便，肛管敏感緊縮也易損傷。
2、感染和炎症：肛管上端齒線處的特殊結構如肛竇、肛門瓣、肛乳頭、肛腺等，容易被幹硬的糞團下移時所損傷，使局部產生感染和炎症，或導致肛腺阻塞化膿，潰破後形成肛裂，由於局部炎症刺激，括約肌痙攣，血液供應不足，傷口久不癒合，形成慢性潰瘍。
3、不良的排便習慣：很多人上廁時習慣吸菸，吸菸能緩衝大腦的排便反射，但容易造成便祕。排便時用力過猛，一些人不管排便感受是否強烈，盲目不停地猛力努掙，只能使直腸肛門和盆底肌肉增加不必要的負擔與局部瘀血，導致疾病發生和發展。有些人有長時間蹲廁的習慣，如廁時，看個小說，玩玩手機，打打電話等等。造成下蹲和排便時間延長，容易造成肛門直腸內瘀血而誘發疾病。
可見造成肛裂的原因通常與我們日常的生活習慣有很大的關係，不良的排便習慣、大便乾結造成肛門皮膚破裂都有可能導致，因此要注意改掉壞習慣，預防肛裂的發生。
