一、咽部疾病引起的咽痛：各種咽部黏膜的感染的感染性炎症刺激和壓迫痛覺神經末梢，導致咽痛。常見疾病如急、慢性咽炎，急、慢性扁桃體炎，皰疹性咽炎，舌扁桃體炎，扁桃體周圍膿腫，咽旁和咽後膿腫，急性會厭炎，咽結核等。
急性炎症咽痛明顯，慢性炎症則咽痛較輕，或無咽痛。另外，咽部的非感染性因素，如異物、外傷、腫瘤潰爛、莖突過長、舌咽神經痛。
二、鄰近器官疾病引起的咽痛：屬於反射性咽痛。口腔牙齒、牙齦的炎症，鼻炎、鼻竇炎，喉部炎症、結核，勁部動脈鞘炎，纖維組織炎，淋巴結炎，甲狀腺炎，勁椎病，食管炎、食管上段異物等，均可引起不同程度的咽痛。
三、全身性疾病引起的咽痛：在一些全身性疾病中，咽痛爲其局部症狀之一，常見病有單核細胞增多症、粒細胞白血病、急性白血病等血液病，流感、流腦、麻疹、猩經熱、傷寒等傳染病，風溼病，痛風等。有些婦女在月經前3~4天內也出現咽痛或灼熱感，這與雌激素水平過高有關。
警惕特殊的咽痛寰樞半脫位由於急性咽炎、急性扁桃體炎治療不當，細菌感染引發的炎症滲出物累及寰樞關節內，引起其支持韌帶的鬆弛，容易導致關節脫位，寰樞關節系頭顱與最上面2塊勁椎骨的連接處，脊髓通過關節位置入顱，其功能的重要性不言而喻，該關節一旦全脫位，後果堪憂。
如治療不當，日久可發生永久性頭部畸形和勁部僵直。 心肌梗死咽喉疼痛是心肌梗死的伴隨症狀之一，耳鼻喉科醫生在見到以咽喉疼痛爲首發症狀的患者時，一定要想到患心肌梗死的可能。
數據顯示：好多患者在心梗發作前，都有發作性咽痛，每次發作咽痛難忍，可放射到勁後，持續約1~2小時，止痛藥亦難以緩解，常被誤診爲咽炎，應用各類咽炎的藥物難已奏效。
急性會厭炎喉嚨劇痛和吞嚥困難是其特徵，發病快，病勢兇險，因病在下嚥部，光用壓舌板檢查就會誤診。會厭位於咽喉深處，平時看不見、摸不着，通過間接喉鏡才能看清真面目。
會厭急性感染時黏膜明顯充血腫脹，使會厭的體積成倍地增大，由原來的扁平狀一下子變成一個圓球，造成氣道阻塞窒息在所難免，此時連氣管插管都非常困難，因此而造成死亡發生。
白細胞減少症由於服用某種藥物可能誘發外周血液中白細胞總數減少，致使抵抗外界感染的能力顯著下降，因此造成咽部、口腔等處的組織損傷，病初可有劇烈的咽痛，吞嚥亦感困難，嚴重的可以呼吸困難。
喉嚨痛前的數日，白細胞已經發生改變，血液常規檢驗即可確診。 喉癌早期症狀爲咽痛，進食、飲水時加重。可有耳痛，如果病變累及硬齶或後上牙齦使戴假牙者不再合適而引起刺激。
咽部不適和異物感爲常見的早期症狀，易被忽略。潰瘍型癌腫，常有少量出血。腫瘤壞死，感染後常有口臭。淋巴結轉移早，易到勁靜脈上淋巴結，有助於早期診斷。
