1.肛瘻很少自愈，都需要治療。上述普通肛瘻、直腸會陰瘻可用“掛線療法”治癒，其他瘻則需要手術治療或掛線與手術相配合的療法。肛瘻掛線很簡單，門診手術即可完成。
2.爲預防和減少新生兒和小嬰兒發生感染性肛瘻，必須注意肛門衛生。家長習慣在換尿布時順手用尿布擦一下肛門和外陰，並且誤認爲尿布很乾淨，也很柔軟，其實對新生兒和小嬰兒來講，尿布還是有些粗糙和不衛生的。
3.最好在便後用裝有溫水或硼酸水的小壺沖洗肛門和外陰，然後再用乾淨的棉花或軟布輕輕擦乾，並塗以少量軟膏(金黴素眼藥膏或鞍痠軟膏)。這樣就能減少肛門周圍皮膚及外翻的直腸粘膜的損傷，達 到預防感染的目的。
