原發性肝癌是指原發於肝細胞或肝內膽管細胞的癌腫，隨疾病的發展，中晚期會出現肝性腦病、上消化道出血、肝癌結節破裂出血、繼發感染等併發症，這些併發症常可導致患者死亡。
1、肝性腦病
肝性腦病過去稱肝昏迷，是由嚴重肝病引起的、以代謝紊亂爲基礎的、中樞神經系統功能失調的綜合徵，主要表現爲意識障礙、行爲失常和昏迷。肝性腦病通常是原發性肝癌終末期的併發症，約1/3的患者死於此症。
2、上消化道出血
原發性肝癌患者常伴有肝硬化、門靜脈高壓、食管胃底血管靜脈曲張、小腸靜脈淤血等一系列變化，血管容易破裂出血，患者表現爲嘔血和黑便，另也有部分患者是因爲肝功能障礙致凝血功能異常而廣泛出血，約15%的原發性肝癌患者死於出血。
3、肝癌結節破裂出血
腫瘤逐漸增大、壞死或液化時可自發破裂，受到外界刺激時也會發生破裂，如破裂侷限在包膜內，則產生明顯的局部疼痛，如穿透包膜則可引起腹膜刺激徵，大量出血可導致休克或死亡，約10%的原發性肝癌患者死於結節破裂出血。
4、繼發感染
原發性肝癌是一種消耗性疾病，晚期患者消耗嚴重，加之放化療導致的白細胞減少，抵抗力微弱，容易併發肺炎、敗血症、腸道感染等。
