類風溼性關節爲病變的組織變化雖可因部位而略有變異，但基本變化相同。其特點有：①瀰漫或侷限性組織中的淋巴或漿細胞浸潤，甚至淋巴濾泡形成。②血管炎，伴隨內膜增生管腔狹小、阻塞，或管壁的纖維蛋白樣壞死。③類風溼性肉芽腫形成。
1.關節腔早期變化滑膜炎，滑膜充血、水腫及大量單核細胞、漿細胞、淋巴細胞浸潤，有時有淋巴濾泡形成，常有小區淺表性滑膜細胞壞死而形成的糜爛，並覆有纖維素樣沉積物。後者由含有少量γ球蛋白的補體複合物組成，關節腔內有包含中性粒細胞的滲出物積聚。沒膜炎的進一步變化是血管翳形成，其中除增生的纖維母細胞和毛細血管使沒膜絨毛變粗大外，並有淋巴濾泡形成，漿細胞和粒細胞浸潤及不同程度的血管炎，滑膜細胞也隨之增生。在這種增生滑膜細胞，或淋巴、漿細胞中含有可用熒光素結合的抗原來檢測出類風溼因子、γ球蛋白或抗原抗體原合物。
血管翳可以自關節軟骨邊緣處的滑膜逐漸向軟骨面伸延，被覆於關節軟骨面上，一方面阻斷軟骨和滑液的接觸，影響其營養。另外也由於血管翳中釋放某些水解酶對關節軟骨，軟骨下骨，韌帶和肌腱中的膠原基質的侵蝕作用，使關節腔破壞，上下面融合，發生纖維化性強硬、錯位，甚至骨化，功能完全喪失，相近的骨組織也產生廢用性的稀疏。
2.關節外病變有類風溼性以下小結，見於約10%～20%病例。在受壓或摩擦部位的皮下或骨膜上出現類風溼性肉芽腫結節，中央是一團由壞死組織、纖維素和含有IgG的免疫複合物沉積形成的無結構物質，邊緣爲柵狀排列的成纖維細胞。再外則爲浸潤着單核細胞的纖維肉芽組織。少數病員肉芽腫結節出現的內臟器官中。
3.類風溼性關節炎時脈管常受侵犯，動脈各層有較廣泛炎性細胞浸潤。急性期用免疫熒光法可見免疫球蛋白及補體沉積於病變的血管壁。其表現形式有三種：①嚴重而廣泛的大血管壞死性動脈炎，類似於結節性多動脈炎；②亞急性小動脈炎，常見於心肌、骨骼肌和神經鞘內小動脈，並引起相應症狀。③末端動脈內膜增生和纖維化，常引起指（趾）動脈充盈不足，可致缺血性和血栓性病變；前者表現爲雷諾氏現象、肺動脈高壓和內臟缺血，後者可致指（趾）壞疽，如發生於內臟器官則可致死。
4.肺部損害可以有：①慢性胸膜滲出，胸水中所見“RA”細胞是含有IgG和IgM免疫複合物的上皮細胞。②Caplan綜合徵是一種肺塵病，與類風溼性關節炎肺內肉芽腫相互共存的疾病。已發現該肉芽腫有免疫球蛋白和補體的沉積，並在其鄰近的漿細胞中查獲RF。③間質性肺纖維化，其病變周圍可見淋巴樣細胞的集聚，個別有抗體的形成。
淋巴結腫大可見於30%的病例，有淋巴濾泡增生，脾大尤其是在Felty綜合徵。
