在臨牀治療中，白塞氏病根據發作與復發、遷延與緩解的長期、緩慢的進行性的加劇表現分爲急性活動期、中間期恢復期與臨牀緩解期三期。治療白塞氏病是根據不同分期的特點進行醫治。
1、急性活動期：脈象多滑數或弦數，舌質淡紅或黯紅，苔薄黃，此屬溼熱內聚，鬱久化火之證，可用導赤散加蘆根、滑石等清心降火，導熱與溼邪從小便而出。若患者發作源於情志過極，肝經火旺，則大多伴有心煩品苦，肋脅脹痛等，可用丹梔肖遙散疏肝瀉火、清熱涼血;病變中若出現高熱煩渴、大便祕結、腹脹腹痛、血象明顯升高，血沉、CRP急劇增高者，屬邪熱內熾。氣分熱盛，可用白虎湯合小承氣湯清氣除熱，通腑瀉濁。
2、中間恢復期：症見口腔或外陰潰瘍好轉、發熱、便祕、腹脹、腹痛已基本消失，血象、血沉、CRP等開始下降或基本恢復正常。然本病爲一種全身性廣泛性的小血管炎症性病變，故此期的治療應是清解餘邪、活血化瘀，可用復元活血湯加丹蔘、枳實等治療。若餘邪較重，低熱不退，煩躁不解，或加用柴胡疏肝散。
3、臨牀緩解期：此期臨牀症狀與體徵基本消失或完全消失，血象、血沉、CRP等實驗檢查指標也恢復正常。初發患者或雖多次發作但無重要臟器受累者常無明顯的陰陽氣血偏盛偏衰表現，故此期治療白塞氏病的原則是提高機體免疫功能，延長緩解期與減少復發，可用十全大補丸口服，持續服用1至2年;若有陰陽偏盛表現，當根據陰陽之偏盛衷情況，分別以左歸丸、右歸丸、杞菊地黃丸、金匱腎氣丸等治療，且需持續用藥1至2年。
治療白塞氏病時若伴有關節、皮膚、腎臟、腸道、神經系統損傷者，或在後期出現器官功能嚴重受累者，應該根據情況詳細辯證，制定相應的製劑或方藥。
