治療原則爲抗炎和引流。
（一）痰液引流，祛痰藥如氯化銨0.3g、沐舒痰30mg、化痰片500mg、祛痰藥10ml，每日3次口服，可使痰液易咳出。痰濃稠者，可用氣道溼化如蒸氣吸入、超聲霧化吸入等以利痰液的引流。患者一般情況較好，發熱不高者，體位引流可助膿液的排出。使膿腫部位處於高位，在患部輕拍，2～3次/d，每次10～15分鐘。有明顯痰液阻塞徵象，可經纖維支氣管鏡沖洗並吸引。
（二）外科治療 支氣管阻塞疑爲支氣管癌者；慢性肺膿腫經內科治療3個月，膿腔仍不縮小，感染不能控制；或併發支氣管擴張、膿胸、支氣管胸膜瘻；大咯血有危及生命之虞時，需作外科治療。
（三）抗生素治療 急性肺膿腫的感染細菌包括絕大多數的厭氧菌都對青黴素敏感，療效較佳，故最常用。劑量根據病情，嚴重者靜脈滴注240萬～1000萬u/d，一般可用160萬～240萬u，每日分2～3次肌內注射。在有效抗生素治療下，體溫約3～10天可下降至正常。一般急性肺膿腫經青黴素治療均可獲痊癒。脆性類桿菌對青黴素不敏感，可用林可黴素0.5g，每日3～4次口服；或0.6g每日2～3次肌內注射；病情嚴重者可用1.8g加於5%葡萄糖溶液500ml內靜脈滴注，每日一次。或氯林可黴素0.15～0.3g，每日4次口服。或甲硝唑0.4g，每日3次口服。嗜肺軍團桿菌所致的肺膿腫，紅黴素治療有良效。抗生素療程一般爲8～12周左右，或直至臨牀症狀完全消失，X線片顯示膿腔及炎性病變完全消散，僅殘留條索狀纖維陰影爲止。在全身用藥的基礎上，加用局部治療，如環甲膜穿刺、鼻導管氣管內或纖維支氣管鏡滴藥，常用青黴素80萬u（稀釋2～5ml），滴藥後按膿腫部位採取適當體位，靜臥1小時。
血源性肺膿腫爲膿毒血癥的併發症，應按膿毒血癥治療。
