1、常規治療 按一般呼吸系統疾病診療常規處理。
2、抗感染治療 原則上應根據細菌學和藥敏試驗結果選用抗生素。可先用青黴素G320萬～960萬U/d，分2～3次靜脈滴注，阿米卡星0.4～0.8g/d，靜滴，待細菌學和藥敏報告後再調整用藥。 合併厭氧菌感染者可加大青黴素G劑量或加用林可黴素1.8g/d，加入葡萄糖液內靜滴，或0.6g，2～3/d，肌注，甲硝唑0.4g，3/d，口服。嚴重者可靜滴頭孢西丁等。在全身用藥基礎上可行局部治療，如經鼻導管或經纖支鏡氣管內滴藥等。總療程爲4～8周。阿米巴肺膿腫應用甲硝唑等抗阿米巴治療。
3、體位排痰和藥物祛痰 根據膿腫部位和病情采取體位引流，2～3/d，每次15～30min。給予祛痰藥物口服，如必嗽平、沐舒痰等，必要時行超聲霧化。
4、經纖支鏡沖洗 膿痰較多或有明顯痰液阻塞徵象者，可行纖支鏡沖洗和吸引。加強支持治療，必要時少量多次輸血。
5、中藥治療 也可用葦莖湯、魚腥草等藥。
6、外科治療 經內科常規治療3個月以上仍咳膿痰、膿腔無明顯改變者，或合併威脅生命的大咯血或不能與肺癌等鑑別時可行手術治療。
治癒標準及隨訪：
發熱消退，無膿痰，X線檢查示病竈消失或纖維化，認爲治癒。病癒出院後，半年內隨訪檢查1～2次，注意有無復發。
