導致自然流產的原因較多，主要有：
1、遺傳基因缺陷：夫婦任何一方有染色體異常可傳至於代，染色體異常的胚胎有50%一60%發生早期自然流產。染色體異常包括：①數目異常：多見三體、X單體、三倍體等。②結構異常：多爲染色體斷裂、倒置、缺失和易位。染色體異常的胚胎即使少數妊娠至足月，出生後會發生畸形或有功能缺陷。如發生流產，妊娠產物有時僅爲一空孕囊或已退化的胚胎。
2、母體因素
(1)全身性疾病：妊娠期患全身性感染，高熱可引起子宮收縮導致流產。細菌毒素和病毒(如單純皰疹病毒、鉅細胞病毒等)通過胎盤進入胎兒血循環，使胎兒死亡導致流產;孕婦患嚴重貧血或心力衰竭可致胎兒缺氧，也能引起流產;孕婦患慢性腎炎或高血壓，胎盤發生梗死也可引起流產。
(2)生殖器官異常：子宮畸形(如子宮發育不良、雙子宮、子宮縱隔等)、子宮腫瘤(如粘膜下肌瘤等)，均可影響胚胎着牀和發育而導致流產。宮頸重度裂傷、宮頸內口鬆弛導致胎膜早破而發生晚期自然流產。
(3)內分泌異常：甲狀腺功能減退症、嚴重糖尿病未能控制、黃體功能不足，均可導致流產。
(4)不良習慣：過量吸菸、酗酒，過量飲咖啡、海洛因等毒品，均可引起流產。
(5)創傷刺激：嚴重休克，子宮創傷(如手術，直接撞擊，性交過度)亦可導致流產;過度緊張、焦慮、恐懼、憂傷等精神創傷也有引起流產的報道。
3、免疫功能異常：妊娠類似同種異體移植，胚胎與母體間存在複雜而特殊的免疫學關係，使胚胎不被排斥。若母兒雙方免疫不適應，則可引起母體對胚胎排斥而致流產。與流產有關的免疫因素有父方的組織相容性抗原(HLA)、胎兒抗原、血型抗原(ABO及Rh)、孕期母體封閉抗體不足、母體抗父方淋巴細胞的細胞毒抗體不足、孕婦抗磷脂抗體產生過多、抗精子抗體的存在等。
4、環境因素：砷、鉛、甲醛、苯、氯丁二烯、氧化乙烯等化學物質的過多接觸，均可引起流產。#p#副標題#e#
按自然流產發展的不同階段，分爲以下臨牀類型：
1、先兆流產 指妊娠28周前，先出現少量陰道流血，常爲暗紅色或血性白帶無妊娠物排出，相繼出現陣發性下腹痛或腰背痛。婦科檢查宮頸口未開，胎膜未破，子宮大小與停經週數相符。經休息及治療，症狀消失，可繼續妊娠;若陰道流血量增多或下腹痛加劇，可發展爲難免流產。
2、難免流產 指流產不可避免。在先兆流產基礎上，陰道流血量增多陣發性下腹痛加劇，或出現陰道流液(胎膜破裂)。婦科檢查宮頸口已擴張，有時可見胚胎組織或胎囊堵塞於宮頸口內，子宮大小與停經週數相符或略小。
3、不全流產 難免流產繼續發展，部分妊娠物排出體外，尚有部分殘留於宮腔內或嵌頓於宮頸口處，影響子宮收縮，導致大量出血，甚至發生失血性休克。婦科檢查見宮頸口已擴張，宮頸口有妊娠物堵塞及持續性血液流出，子宮小於停經週數。
4、完全流產 指妊娠物已全部排出，陰道流血逐漸停止，腹痛逐漸消失。婦科檢查宮頸口已關閉，子宮接近正常大小。
此外，流產有三種特殊情況：
1.稽留流產 指胚胎或胎兒已死亡滯留宮腔內尚未自然排出者。胚胎或胎兒死亡後子宮不再增大反而縮小，早孕反應消失。若已到中期妊娠，孕婦腹部不見增大，胎動消失。婦科檢查宮頸口未開，子宮較停經週數小，質地不軟，未聞及胎心。
2.習慣性流產 連續自然流產3次或以上者稱爲習慣性流產.近年國際上常用複發性流產取代習慣性流產，改爲連續2次的自然流產。每次流產多發生於同一妊娠月份，其臨牀經過與一般流產相同。早期流產常見原因爲胚胎染色體異常、免疫因素異常、黃體功能不足、甲狀腺功能低下。晚期流產常見原因爲子宮畸形或發育不良、宮頸內口鬆弛、子宮肌瘤等。宮頸內口鬆弛者於妊娠後，常於妊娠中期，胎兒長大，羊水增多，宮腔內壓力增加，胎囊白宮頸內口突出，宮頸管逐漸縮短、擴張。患者多無自覺症狀，一旦胎膜破裂，胎兒迅速排出。
