成人的CD4細胞爲每毫升500~1600個，艾滋病病毒感染者的CD4細胞可能會出現進行性或不規則性下降，提示感染者的免疫系統受到了嚴重損害，當CD4細胞小於每立方毫米200個時就可能會發生多種嚴重性機會性感染或腫瘤。目前最新規定hiv感染者的CD4記數水平低於350個就可以開始治療。
CD4+細胞的功能（以其對特異性刺激的增殖反應測定）在細胞數目下降前減弱，或許與DC功能相關。CD4+細胞最早的異常是對記憶抗原反應減弱，其後出現同種抗原刺激的增殖減少，最後對外源凝集素的反應缺失（如植物血凝素）。表現出三種反應均下降的感染者比那些具有全部或部分免疫功能的人更快發展到艾滋病。多數研究中，HIV感染者的HIV特異CD4+T細胞增殖反應低，但急性感染早期進行抗病毒治療可能維持CD4+T細胞的增殖活性，這一活性可能對延緩疾病進展很重要。基於細胞培養研究的結果，一些研究者相信CD45 RO+記憶性CD4+T細胞的優先感染導致了免疫功能的紊亂。CD45RO+細胞的感染通常主要是R5病毒感染所致。需要注意的是，似乎病毒進入CD45 RA+原態細胞和CD45RO+CD4+記憶細胞是相同的，但病毒複製主要發生在CD45RO+細胞，且此類記憶細胞對HIV的細胞毒效應更敏感。重要的是原態T細胞隨時間而減少，可能是IL-7能使CD4+T細胞對HIV的敏感性增加。不論是宿主體內選擇感染的存在和這種選擇性感染與免疫系統紊亂的關係，還是原態T細胞成爲記憶CD4+細胞，都仍需深入研究。體內CD4+CD45RO細胞中可檢測到HIV。HIV對CD4+T細胞的其他效應 HIV複製的其他直接效應，除細胞破壞外，可能會促進CD4+細胞數量減少和功能的下降。例如，HIV感染T細胞克隆導致細胞因子產生異常。並且，儘管不能在大量CD4+細胞（尤其是無症狀感染者）中檢測到HIV-1複製，HIV可能以一種潛伏或沉默狀態存在，從而影響這些細胞的功能、長期存活及發育。這種隱蔽的細胞感染狀態已用原位DNA和RNA PCR技術證實。因此，即使沒有高水平復制，HIV也可能改變細胞因子的產生和CD4+細胞膜的完整性，從而影響細胞增殖等正常功能，並增加細胞對特定細胞因素（細胞因子）毒性效應的敏感性。HIV對CD4+細胞功能的影響，及其他效應
