艾滋病病人有呼吸困難、缺氧、胸痛等症狀，胸部透視顯示瀰漫性浸潤。在北美和歐洲最常見的致命的機會性感染爲卡氏肺孢子蟲所致的肺孢子蟲肺炎。還有兩種病毒也可致成同樣的肺部症狀。此外，剛地弓形蟲感染也可致成肺炎，糞類圓線蟲（strongyloides stercoralis）的幼蟲也常侵襲艾滋病患者的肺部。這裏重點地介紹肺孢子蟲肺炎：卡氏肺孢子蟲原來譯成卡氏肺囊蟲，但它究竟屬於哪一類生物，到現在還沒有完全確定。它形成芽拖，有人認爲它可能是一種酵母，但大多數人則認爲它是一種孢子蟲。由於卡氏肺孢子蟲的大量繁殖，使肺泡腔擴大，充滿蜂窩樣物質，肺孢子蟲分裂成團，形成肺孢子蟲囊腫。它們粘附在肺泡壁上，使肺泡間隔的微血管堵塞，妨礙血和氣體的交換。由於咳嗽，使肺泡子蟲從一葉擴散到全肺，咳嗽也可將包囊咳出到呼吸道內，吸氣時又將包囊吸入到其它肺葉的支氣管內，氣流和重力使它們進入新的肺泡。狗、豬、狐、兔和羊等體內都有發現。實驗室飼養的正常實驗動物，如大白鼠和豚鼠的肺部就常有隱性感染，不表現症狀，只要用醋酸可的鬆每週注射2次，一個月後即可誘發肺孢子蟲肺炎，似乎肺抱子蟲原來就隱藏在它們的肺內。艾滋病患者是否原來肺內也有隱性感染，在感染了艾滋病病毒之後才誘發了肺孢子蟲肺炎，或者是由動物傳給抵抗力低的艾滋病患者，尚不清楚。此蟲在患者的肺泡中發育和繁殖，由滋養體經包囊前期變成包囊。包囊的核由1個分裂成8個，形成8個子孢子，即爲成熟包囊，子孢子從包囊逸出再發育成滋養體。用普通染色的標本中只有8核包囊較易辨認，從氣管鏡取出的活組織或尸解取得的標本，可用果氏銀染法觀察到着色的肺孢子蟲囊腫。
肺孢子蟲肺炎是歐美艾滋病患者中最常見的機會性感染，感染率平均高達57%，常致死亡。艾滋病患者最初的表現就是肺孢子蟲肺炎，它可發生在60%以上的患者中，在臨死前患這種病的百分率就更高。患者常常是因患肺孢子蟲肺炎住院而後被確診爲艾滋病患者。1985年6月6日在北京協和醫院死去的阿根廷旅遊者，在1984年11月即患過肺孢子蟲肺炎。卡氏肺孢子蟲寄生在肺泡內，因一般病理切片所用的蘇術素伊紅染色劑（H一E〉染色不容易辨認，因此常常診斷爲間質性漿細胞肺炎。由於卡氏肺孢子蟲的大量繁殖，使肺泡腔擴大，充滿蜂窩樣物質，肺孢子蟲分裂成團，形成肺抱子蟲囊腫。它們粘附在肺泡壁上，使肺泡間隔的微血管堵塞，妨礙血和氣體的交換。由於咳嗽，使肺子孢子蟲從一葉擴散到全肺，咳嗽也可將包囊咳出到呼吸道內，吸氣時又將包囊吸入到其它肺葉的支氣管內，氣流和重力使它們進入新的肺泡。
