人類生殖器皰疹的傳染源是患者及亞臨牀無症狀的帶病毒者，尤其是在患者的生殖器皮膚或粘膜的皰疹內含有單純皰疹病毒，可通過性接觸而傳染給配偶或其他性侶，也可在同性戀者中互相傳染。有時在口腔或口腔周圍患有皰疹的人，可通過口腔－生殖器性交，使對方傳染生殖器皰疹。因此，不同方式的異性性行爲，也可傳播生殖器皰疹病。
由於有感染性的病毒能在潮溼的環境中存活數小時，因而單純皰疹也可通過污染物而間接傳播。生殖器皰疹是一種普遍的性疾病，因爲生殖器皰疹在潛伏其中也有傳染性，所以會讓人在不知不覺得情形下成爲皰疹的的傳播者和受害者。
