（一）病毒性感染症
1.鉅細胞病毒感染是一種少見病，但在AIDS患者中約佔90%，是AIDS常見的併發症，也是AIDS患者致死的一個重要的合併症。感染可累及肺、消化道、肝及中樞神經系統和多個臟器，約有1/3患者合併網膜炎，臨牀症狀爲發燒、呼吸急促、發紺、呼吸困難等，胸部X線照片多出現間質性肺炎的改變，雙肺野可見瀰漫性的毛玻璃或網狀小顆粒狀陰影，晚期因肺泡腔中分泌物貯留而發展爲肺泡改變，AIDS患者對鉅細胞病毒的抗體效價升高。
2.單純皰疹病毒感染症：單純皰疹病毒（Herpes Simplox Virus，HSV）引起的感染症與CD4T淋巴細胞數有關，在口脣、陰部、肛周處形成潰瘍病變、皰疹性瘭疽（廣泛皮膚糜爛）等難治病變，疼痛明顯，也可以見到皰疹性肺炎，消化道及皰疹性腦炎。血清學方面診斷意義不大，可用基因診斷方法確診。治療選用無環鳥苷靜滴。
3.帶狀皰疹（Herps zoster）本症是由水痘——帶狀皰疹病毒（Varicella-Zoster virus，VZV）引起，在美國50歲以下的患帶狀皰疹者應懷疑有HIV感染的可能。非洲多數患者呈現顏面帶狀皰疹以至發展網膜壞死。治療同單純皰疹病。
（二）細菌性感染
1.非典型抗酸菌症：AIDS患者併發細菌感染，多爲分枝桿菌所致的全身感染。本病無自覺症狀，在臨牀上也沒有特異性的表現，有些病人出現盜汗、高熱、全身衰弱、腹瀉、腹痛、吸收不良等消化系統症狀。此外還可見到貧血、體重下降。診斷主要靠血液培養。治療多用抗結核藥物，但常常有耐藥性。由於該感染不會危及生命，所以可採取消炎、解熱鎮痛劑及加強營養等對症療法。
2.結核病，AIDS患者常常發生結核病的復發。以肺外重症全身感染多見，胸X片多爲正常，由於AIDS患者免疫系統受到破壞，所以結核菌素反應多爲陰性。因多爲全身感染，故在糞便、血液、尿、痰以及淋巴結、肺、肝、胃腸粘膜、骨髓等活檢標本的塗片，培養均有結核菌的存在，在診斷上意義較大。治療可用抗結核藥物。由於結核菌可以通過飛沫感染等方式向健康人擴散，對可疑併發結核病的AIDS患者應服用雷米封預防。
（三）深部真菌感染症
1.念珠菌病（Candidiasis）念珠菌感染是機會真菌症中最常見的一種。在AIDS中顯得優爲突出，除了合併皮膚、口腔淺部念珠菌感染外，還可引起食道念珠菌病。可出現體重減少，倦怠感，非特異的消化系統症狀主要有嚥下困難，胸骨後疼痛。診斷可進行白色念珠菌分離。AIDS早期診斷依據中，本症佔很重要的位置。治療，採用抗真菌劑，可使症狀好轉，但易再發，顯示難治性。
2.隱球菌病（Cryptococcosis）AIDS患者合併隱球菌病的發病率爲6%，以腦脊髓膜炎最爲多見，亦可合併肺隱球菌病或隱球菌心外膜炎，臨牀上主要表現爲發熱、頭痛、倦怠感、羞明、精神狀態變化、痙攣等症狀。腦脊液檢查在診斷上很重要，蛋白、細胞數增加，髓壓升高，糖減少等。
（四）原蟲、寄生蟲侵染。 卡氏肺孢子蟲性肺炎（Pneumocytsis carinii pneumonia PCP卡氏肺炎）：卡氏肺孢子蟲是衆所周知的典型的機會感染的病原體之一，一般在健康人的肺泡中也有寄生，但多爲不顯性，也是人畜共患的一種疾病，當其宿主免疫功能受某種原因使其減退時得以繁殖及發揮其病原性，在AIDS中由於免疫系統受到損害，而導致卡氏肺孢子蟲肺炎的發生。 卡氏肺包子蟲肺炎是非常重要的機會感染症，在初發AIDS時有60%併發此症，全病程中將有80%-85%合併本症。艾滋病初期症狀由於低氧血癥出現進行性呼吸障礙爲特徵，特別是勞動時出現氣喘、呼吸困難、乾性咳嗽、發熱等自覺症狀。 胸X片所見，多爲非特異的浸潤陰影，5%顯示正常。咳痰粘稠，確診需檢出卡氏肺孢子蟲，取材時先洗淨支氣管肺泡，經支氣管取材或開胸取肺組織活檢。
關於ADIS併發卡氏肺炎與非AIDS併發卡氏肺炎，在臨牀上有所不同
臨牀症狀
比較緩慢症狀長時間持續、發熱、PaO2，x-p等稍緩慢 發病急 症狀急劇 治療效果 約兩週以上 約1～2周以內 ST合劑的副作用 發疹等副作用頻發發病率64.7% 副作用輕微者多發病率11.8.% 死亡率 一次發病到死亡約佔50% 20%～50% 再發率 高（約20%） 低（成人基本0%，小兒佔11.8%） 病理組織象的改善 表現延遲多 經治療，早期改善 P.C的殘留 長期殘留者多 由於治療，顯著減少 全身播散可能性 多（？） 少（？） 治療：複方新諾明爲首選藥物，其有效率與AIDS以外的其他免疫缺陷患者幾乎相同，約佔50%～60%，但該藥引起的藥物性發熱、皮疹、白血球、血小板減少、肝功能障礙等副作用的發生率較高，在不經治療情況下，幾乎100%死亡。 AIDS患者還可併發類似於孢子蟲病。如阿米巴病，毒漿體原蟲病，隱性孢子蟲病。
