(1)在無菌條件下，挑破傳染性軟疣的頂端，可見到乳酪樣的軟疣小體，然後用鑷子輕輕擠出。或直接用小鑷子夾住疣體將其拔出，而後塗2%-2.5%碘酊，壓迫止血即可。數目多者，皮損消毒後，將軟疣刺破，塗以5%-10%碘酊，逐日1次，可在7天內乾涸脫落。
(2)酞丁安霜具有抗病毒的作用，以之塗於疣體表面，逐日2～3次，連用3周。如療程結束後軟疣仍不能消除，要刮除或拔出。
(3)1%的5-氟尿嘧啶溶液外用，逐日2～3次，連用2周。用時以棉籤蘸藥液少許，直接點於疣體的頂端。
(4)0.1%的維生素A酸溶液外用，逐日2次，連用2周。要留意保護四周皮膚。
(5)70%苯酚酒精局部外用，用吸有藥液的小針管，對準皮損逐個點藥，點於疣體中心。一般一個疣體點2次即可，10天后皮損可自行脫落。
(6)液氮冷凍，用冷凍器將液氮噴於疣體表面，解熔3次即可。一般1周後疣體脫落。
(7)滅菌竹籤蘸少許濃來蘇水直接點塗軟疣表面。較大皮疹，夾出軟疣小體再行治療。10天后復點一次。
(8)99%冰乙酸15ml加進20g食用麪粉中，拌勻成糊狀，外塗於疣體。
一般不需全身用藥。若皮疹過多可採用以下辦法：
1、抗病毒：①病毒唑0.2，日2次肌注;②聚肌胞2mg，隔日1次肌注;③病毒靈0.2，甲氰咪胍0.2，口服逐日3次。
2、促進免疫：左旋咪唑50mg，1日3次口服，連用3天，間歇11天。
