不完全直腸脫垂的原因大致有以下幾個方面：
1、肛門括約肌無力和直腸周圍脂肪含量少：即指年老體弱無力者，括約肌鬆弛，骨盆直腸窩、坐骨直腸窩脂肪量減少，從而導致直腸固定困難，引起直腸不完全脫垂。
2、骶骨曲未形成：嬰兒期脊髓發育較慢，骶骨曲尚未形成，骨盆和直腸幾乎筆直，當長期增加腹壓時，可引起直腸粘膜和直腸全層脫垂。
3、骶尾神經損傷：手術損傷、外傷或其他病變侵犯了骶尾神經，導致肛提肌麻痹，造成直腸脫垂。
4、肛門直腸部手術損傷：如環形痔手術後，肛瘻、肛門直腸周圍膿腫手術，破壞了肛管直腸環，導致直腸粘膜脫垂。
5、其他：腹瀉、便祕、慢性劇烈腹痛、分娩等，也可導致直腸脫垂。
