正常子宮內膜生長在子宮腔內，如果這種子宮內膜組織生長在盆腔的其他部位，就形成子宮內膜異位症。子宮內膜異位症的發病機制，解釋很多，其中以“經血倒流，內膜種植”的學說最具說服力，根據這一理論，在某些婦女中，行經期脫落的子宮內膜逆流到輸卵管，經過傘端，逸入盆腔，就地種植，繼續生長，就形成了子宮內膜異位病竈。
這種異位內膜病竈在卵巢激素的週期性刺激下，同樣可以發生增殖，分泌以及行經第一系列變化，而所產生的經血卻沒有一個排泄的出路，聚集起來成爲大小不同的結節。這類結節的好發部位爲卵巢，其次是子宮直腸窩以及盆腔的漿膜面。
其中，發生在卵巢的子宮內膜異位症，可以生長到較大的體積，直徑自數釐米以至10餘釐米不等，通常稱爲子宮內膜異位症，可以生長到較大的體積，直徑自數釐米以至10餘釐米不等，通常稱爲子宮內膜異位囊腫。由於囊腫內含陳舊性的深褐色的粘稠性經血，看起來很像巧克力醬，故又叫做“巧克力”囊腫。這種巧克力囊腫的壁，質地鬆脆，在月經週期後半和行經期，由於局部充血和出血，囊內壓力升高，可以造成囊壁破裂囊腫內所含之陳舊經血，通過破口，流入腹腔，刺激腹膜，引起急性腹痛。
子宮內膜異位症在50年代，還是一種不爲國內臨牀工作者所知的疾病。近20餘年來，發病率明顯上升，據統計，大約每3例原因不明的不孕女性，就有一例系因子宮內膜異位症所引起，每10例因盆腔腫物行剖腹手術者，就可以出現一例內膜異位症，因此已成爲當前的一種多見病。患者多爲生育年齡婦女，既往常有不育或生育功能減低的歷史，約半數以上病例伴有嚴重痛經，1/4病例伴有輕度痛經。
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卵巢巧克力囊腫破裂多數發病於黃體期或行經期，主要表現爲突然發作之持續性下腹劇痛，但沒有異常陰道出血。疼痛常從一側開始，以後擴散至全下腹，其劇裂程度常常超過其他原因引起之婦科急腹症，並往往伴有肌緊張、反跳痛等腹膜刺激徵，但出現休克極罕見。部分病例可有輕度的體溫和白細胞計數升高。盆腔檢查大約2/3病例可以觸到壓痛的宮旁腫塊，餘者由於腹肌抵抗，患者難於合作，而查不到明顯的腫物。部分病例可觸到子宮直腸窩或骶韌帶上的壓痛結節。
本病多見於20-45歲以下，初起爲單側囊腫，延久可見雙側囊腫。一般要先行婦科檢查，以手探查，或雙合診等診斷方法，在附件部分可摸到囊性腫塊，而憑指端感覺提示卵巢囊腫大小，表面光滑而活動者爲良性囊腫。從臨牀所見，未婚少女，症見月經失調，經行量少，經行腹痛，或絞痛，或小腹吊痛，最重者則見腹部劇烈疼痛，甚至昏厥，已婚婦女，症見經量過多，或淋漓不淨，交替出現，頭暈腦脹，乳房脹痛，腰部 痛，伴有帶下色黃，有腥氣，或帶下粘稠色白，或赤白帶下等。
本病的診斷主要依靠臨牀醫生對這類新型急腹症的認識。如患者有痛經或明確的子宮內膜異位症之歷史，則更應嚴重考慮本病的診斷。盆檢不滿意時，通過B超聲檢查可對探出宮旁腫塊。陰道後穹窿或腹腔穿刺對診斷幫助很大。從巧克力囊腫的破口中流出的陳舊性經血，經腹腔液稀釋，成爲一種稀薄褐色的液體。如穿刺時獲得這種液體，則診斷即可明確了。
手術方式需視患者對生育的要求而定，如患者年青並渴望生育，應儘量切除病竈，鬆解粘連，保留子宮及正常卵巢組織，爲日後生育創造條件。但由於巧克力囊腫破裂行手術者，其複發率遠比較未破裂者爲高，因此對於年齡較大已有子女的患者，爲了避免復發，仍以切除子宮爲宜。
