卵巢囊腫的分類不同，因此對於各種卵巢囊腫的形成原因也不相同，但總體說來卵巢囊腫也是同不良生活習慣等因素有關係的。
各種卵巢囊腫的形成原因：
1、功能性囊腫：
這是最常見的囊腫。發生在排卵週期的育齡婦女，異常量的液體聚集在濾泡內或黃體內，形成濾泡囊腫或黃體囊腫。
2、巧克力囊腫：
是指子宮內膜異位症長在卵巢內，在卵巢內形成大量黏稠咖啡色像巧克力狀的液體。
3、漿液性上皮囊腫及黏液性上皮囊腫：
具有分泌功能的漿液細胞及黏液細胞在排卵後被包埋在卵巢內，不斷的分泌液體形成囊腫。
4、出血性囊腫：
濾泡囊腫及黃體囊腫生長過速，造成卵巢的組織牽扯而裂開流血。這些血液因沒有出口出去而積在卵巢裏，就稱爲出血性囊腫。
5、畸胎瘤：
是在胚胎時期的細胞分化上出了問題， 經過很久的時間才表現出來。它會在卵巢內生成毛髮、牙齒還有一些油脂類的聚集。
6、卵巢癌：
罹患卵巢癌的機率相當低，但因爲位於骨盆腔內，並不容易早期發現
