《入殮師》主人公大悟有着悲慘的身世，在他小時候，父親爲了跟情人私奔，拋棄了他和母親，當父子再相見時，已經陰陽相隔，大悟親自辦理了父親身後事，很好奇，當初，大悟父親是跟誰私奔的？爲什麼會孤獨離世？
大悟本來是大提琴手，樂隊解散後，他回到鄉下成爲一名入殮師，妻子知道真相後讓他換工作，可大悟堅持自己的想法，久而久之，大悟愛上入殮師工作，最後他和妻子和好了，與此同時，大悟得到父親孤獨離世的消息。
對於父親的離開，大悟心裏很矛盾，他既悲痛又憤怒，在給父親入殮時，大悟發現父親手裏握着以前父子互贈的石頭，這時候大悟才知道父親牽掛着他，父親是帶着愧疚和遺憾離開的，所以大悟釋然了，不再糾結父親給他幼小心靈造成的傷害。
大悟六歲時，他的父親拋妻棄子跟店裏的服務員私奔，一直以來，大悟對父親是怨恨的，他也思念父親，可是這樣做覺得對不起母親，是母親辛辛苦苦把他撫養長大。
大悟長大後爲了追逐夢想去了國外，母親去世時，大悟沒能回來，連母親的葬禮也來不及參加。大悟能夠成爲入殮師跟原生家庭有關係，父親離開給大悟留下沉痛的心理創傷，他恨父親拋棄他和母親，這已經成爲大悟難以解開的心結，自從他當了入殮師後，將所有事都看開了，在入殮逝者的過程中，大悟的原生創傷也在慢慢撫平，直到父親的死訊傳來，大悟才徹底釋放自己長久以來的痛苦和壓力。
大悟怨恨父親當年的決絕，可是逝者已矣，再計較有什麼用，他畢竟是自己的父親，大悟父親當年跟情人私奔不久就分手了，所以纔會孤獨死去。
