洗牙根據所使用的器械不同，可以分爲手工潔治和超聲波洗牙兩種。手工潔治即使用不同型號的手工潔治器進行操作，超聲波洗牙則是使用超聲潔牙機進行操作。但二者各有優缺點，應選擇適宜自己的洗牙方式進行洗牙。
手工潔治洗牙
優點：對醫生而言，手工潔治的手感更好，可以更爲真切地感覺到牙石的存在。手工潔治的力量較爲柔和，並且操作過程中沒有噴水，患者不會產生強烈的不適感，也會減少診室內交叉感染的機會。
缺點：費時費力。通常完成全口牙齒的手工潔治需要3個小時左右，對於牙石特別多的患者甚至還要分次完成，在這個過程中患者需要保持張口。長時間的張口對患者來講無疑是很不舒服的，而且長時間的操作對醫生更是一種折磨。因此在臨牀上，手工潔治應用的越來越少，取而代之的是超聲潔波洗牙。
超聲波洗牙
優點：省時省力。超聲波洗牙機上帶有噴水系統，在啓動工作頭超聲振動時，噴水系統同時向工作頭噴水，形成氣霧，一方面起到冷卻工作頭的作用，另一重要方面是形成空穴作用，即在噴霧的水滴內有細微的真空泡迅速塌陷而產生能量，對牙石、菌斑等產生沖刷作用，並將震碎的牙石和血污沖走，一般一小時左右可以完成全口牙齒的齦上潔治。
缺點：有些患者不適合應用超聲波洗牙。有傳染性疾病的患者如結核、乙肝抗原陽性、HIV感染等患者禁用超聲潔牙機，因爲它所產生的噴霧會污染操作區及周圍的環境。有呼吸系統疾病的患者不應使用超聲潔牙機，如：呼吸抑制的患者、患慢性肺病的患者等，超聲治療中的噴水、噴霧會給這些患者帶來危險。一般戴心臟起搏器的患者禁用超聲潔牙機，以避免因干擾起搏器的工作而造成患者心律紊亂等症狀。
