結腸癌治療原則是以手術切除爲主的綜合治療，同時聯合化療、放療等降低手術後複發率，提高生存率。對於不能切除的結腸癌，可採取新輔助化療，一方面可以降低腫瘤的分期，使部分不能切除的腫瘤轉化爲能夠切除的腫瘤;另一方面可延長患者的生存時間，提高患者的生存質量。現將結腸癌主要治療方法列舉如下：
手術治療
根治性結腸癌手術的切除範圍包括癌腫所在腸袢及其全結腸繫膜(complete mesocolic excision ，CME)。即切除了癌腫本身，又可以徹底清除了可能轉移的區域淋巴結。因此，只有進行了徹底的手術纔有可能治癒結腸癌。
另外，對於有肝、肺轉移的患者，也不是完全喪失了治療的機會。新的觀點認爲，如果轉移病竈能夠同時切除，就與結腸癌的病竈一起切除，轉移竈不能切除先進行新輔助化療，降期後再切除。在一部分肝轉移患者中，肝轉移侷限一葉或一段，手術切除不但簡單，而且5年生存率可達50%。手術適應證的選擇與外科醫生的經驗是決定手術的關鍵因素。
肺是結腸癌最常見肝外轉移部位，發生率爲10%～25%，如果不加以治療，其平均生存時間不超過10個月。隨着外科治療經驗的積累，更多的外科專家認爲只要肺轉移竈可以完全切除，即使轉移瘤爲多發，也建議進行手術治療。外科手術治療5年生存率可達22.0%～48.0%。
其他治療
化療：結腸癌隨着生長發育逐漸向遠處轉移，有3/4的患者在診斷時就已經有轉移，能夠接受根治性手術切除者，也有半數患者最終發生遠處轉移。因此，根治術後的化療即輔助化療是結腸癌綜合治療的一個重要組成部分。輔助化療的機理在於用化療控制減滅根治術後體內的殘留病竈。術後機體荷瘤減輕，遠處微小轉移竈的增殖導致其對化療的敏感性增高，術後早期化療可以達到最大的消滅腫瘤的目的。
放療：對於不能切除的腫瘤或有遠處轉移病竈者，局部放療也是晚期結腸癌治療常用的方法之一，可以使腫瘤縮小，改善患者的症狀，常和其它治療方案聯合應用。目前研究較多、效果較好的是外科和放射的綜合治療，包括術前放射、術中放射、術後放射、“三明治”放療等。
但放療對機體有較大的傷害，對身體機能差的晚期結腸癌患者應慎用，一定要防止毒副作用造成的人體免疫功能的損傷。
生物治療：免疫療法和基因療法均屬於生物治療，目前臨牀上應用得較多的是免疫療法。主要是調動人體的天然抗癌能力，恢復機體內環境的平衡，相當於中醫的“扶正培本，調和陰陽”。生物治療能夠預防腫瘤的復發和轉移，還能提高放療、化療的療效，減少放療、放療的毒副作用。
靶向治療：所謂的分子靶向治療，是在細胞分子水平上，針對已經明確的致癌位點(該位點可以是腫瘤細胞內部的一個蛋白分子，也可以是一個基因片段)，來設計相應的治療藥物，藥物進入體內會特異地選擇致癌位點來相結合發生作用，使腫瘤細胞特異性死亡，而不會波及腫瘤周圍的正常組織細胞，所以分子靶向治療又被稱爲“生物導彈”。
2010年美國臨牀腫瘤協會(ASCO)報告，分子靶向治療在結腸癌上帶來了許多令人鼓舞的研究結果，如單克隆抗體與化療聯合方案可使患者平均生存期延長24個月左右。
但是靶向治療的研究纔剛起步，靶向治療的預測指標仍不明確，也就是說，我們難以在用藥前預測患者是否從治療中獲益。雖然一些靶向藥物對晚期結腸癌治療的療效已經獲得公認，但是這些藥物應用時間及應用方式仍存在很大的爭議。隨着靶向藥物的廣泛應用，耐藥問題也日益突出。目前結腸癌的藥物治療處於從單純細胞毒性治療逐漸過渡到分子靶向治療時代。結腸癌的靶向治療研究任然任重而道遠。
中藥治療：目前多數是配合手術或化療進行綜合治療。可以減少化療的副作用和增強機體的抗病能力。根據患者具體情況辯證論治。以清熱解毒、祛瘀散結，實則攻之，虛則補之爲治療原則。
因此，結腸癌的治療原則是以手術爲主的綜合治療。治療目的，一是延長生命;二是提高生存質量。
