男性性病性淋巴肉芽腫一般在染上後3個星期發病。起初在生殖器上出現一個針頭大或綠豆大的糜爛、水皰、丘疹或膿疤。男性病變常發生在龜頭或包皮上，女性則發生在子宮頸或陰道後穹窿上，因爲無 痛感，故不易發現。病變消失後，留下瘢痕。
男性性病性淋巴肉芽腫性病約兩個月後，在一側腹股溝有淋巴結腫大、疼痛、發硬，表面皮膚紅腫、疼痛，以後破潰形成瘻孔，有淡黃色的膿從瘻孔流出。這時病人發燒，全身不舒適，不思飲食， 關節痛，眼角膜發炎，嚴重者還有肝、脾腫大、貧血，甚至出現腦膜炎的症狀。
