注射乙肝疫苗時應當注意的事項大致有以下幾個方面：
1、凡發熱、嚴重感染及其他嚴重的全身性疾病者，應暫緩接種。
2、新生兒第一針必須在出生後24小時內注射，若超過48小時後注射。則預防效果降低。出生後一個月仍未行注射者，則應先檢測有關乙肝指標，證實未被感染者，可與乙肝高效價免疫球蛋白，(HBIG)合用。
3、乙肝疫苗與其他疫苗如白百破;卡介苗、乙腦疫苗等同時接種，互相之間無干擾作用;但有人認爲若與麻疹疫苗同時接種，有可能降低麻疹疫苗的免疫效果，故二者最好分開接種。
4、注射後局部應保持衛生，最好三天內不要擦洗，以免抓破引起局部感染。
5、注射第3針疫苗後的1-3個月，應到醫院檢測保護性抗體(抗-HBs)水平，以判斷免疫效果。若無效者，需行加強注射一次。
6、成人注射前需先檢測乙肝病毒(HBV)指標，已有感染，或感染後已痊癒併產生保護性抗體者，不需注射疫苗。
