在飯前飯後用生理鹽水給寶寶漱口;對不會漱口的寶寶，可以用棉棒蘸生理鹽水輕輕地清潔口腔。對於口腔潰瘍症狀相對嚴重的患兒，應根據醫生囑託適度採取藥物治療，例如：給患兒含服華素片;也有患者反應，將華素片研成粉末，用棉籤沾上敷於潰瘍面，療效很好。華素片的主要成分“西地碘”能在口腔局部迅速殺滅各種致病微生物，從而有效收斂消腫，改善潰瘍面的血液流通，迅速緩解口腔潰瘍給患兒帶來的疼痛，並促進寶寶受損的口腔黏膜癒合。
除此之外，此時宜給寶寶吃清淡、溫性、可口、易消化、柔軟的流質或半流質，切忌食用冰冷、辛辣、鹹等刺激性食物。
手足口病有自愈傾向，且愈後不留痕跡，因此預後較好，但由於該症能引起嚴重的併發症，因此應及早用藥，以控制其發展蔓延。
中西結合治手足口病
中醫方面
可用金銀花、板藍根、連翹各6克，黃連3克，煎水漱口。痛甚、牙齦紅腫者，用板藍根10克，黃芩、白蘚皮各6克，雙花3克，竹葉、薄荷各2克，煎水含漱。手足紅腫明顯，可用黃芩、黃連、丹皮各10克，紅花6克，煎水浸泡。瘙癢者可用生地、丹皮、板藍根、白蘚皮、地膚子各10克，忍冬藤20克，紅花6克，煎水清洗患處，每日3次，連用1周。
西藥
可用維生素B2，每次5毫克，每日3次。左旋咪唑每次每公斤體重1.25毫克，每日2次。外用0.1%雷凡奴爾液含漱，每天5次;0.02%鹽酸洗必泰液含漱，每日5次;金黴素甘油糊劑塗患處，每日4次。
