藏醫學認爲，人體泌尿系統是一個軸形結構，男性從下往上以生殖器、尿道、前列腺、膀胱爲中軸，通過腺管連接着睾丸、精囊、腎臟;女性從下往上以生殖器、尿道、膀胱、子宮爲中軸，通過腺管連接着卵巢、附件、腎臟，這個軸形結構，藏醫學稱之爲 “尿腺軸”。“尿腺軸”內各個器官通過腺管相連，實現生理功能的相通，但由於尿腺軸內器官互相相通，某一個器官一旦感染病菌，病菌就會順着腺管遊走，很容易漫延到 “尿腺軸”的其他器官內。
常規治療靶向性太強，以單一治療爲主，前列腺發病則治療前列腺，尿道發病則治療尿道，對於隱藏在尿腺軸系統其他器官內的病菌無法清除，造成停藥後，病菌順着腺管再次回到原發病竈，使病情反覆發作，難以徹底痊癒。
人體尿腺軸系統是通過外生殖器直接與外界相通的，而且作爲人體的“排污系統”，非常適合病菌繁殖。病菌一旦順着生殖道感染進來，就可以暢通無阻地到達系統內各個器官中。因爲尿腺軸系統就像居民樓裏的供水系統一樣，各個器官都是通過腺管相連的，因此係統中任何一個器官感染病菌，就會順着腺管到處蔓延，引起整個系統的污染。比如尿道發炎，病菌就可以順着尿道感染至前列腺、膀胱，或睾丸、腎臟等，致使整個尿腺軸系統都存在病菌。因此治療時單一針對尿道治療只是臨時緩解症狀，一旦停藥，尿腺軸系統內其他地方的病菌就會再次蔓延至尿道，造成疾病復發。而且，因爲尿腺軸系統褶皺叢生，腺管細微繁多。因此，病菌在尿腺軸系統內任一器官角落都可以藏匿，很難完全殺滅。這就是非淋治療遷延難愈的原因，只有採用尿腺軸藥物才能徹底的清除尿腺軸中隱藏的病菌，抵禦非淋復發。治療結束一週應隨訪複查。
非淋菌性尿道炎治癒標準：
1、臨牀症狀消失1周以上，尿道無分泌物，或分泌物中白紅胞≤4個/100倍顯微鏡。
2、尿液澄清，沉渣鏡檢陰性。
3、尿道(宮頸)標本衣原體、支原體檢查陰性(有條件時)。
非淋菌性尿道炎注意事項
1、治療期間不許飲酒。
2、當完成一個療程後應進行隨訪。
3、患者是否按時、按量治療。因爲非淋菌性尿道炎的治療不同於淋病能做到短期足量治療，而且服藥次數多，持續時間長，患者容易因公因事而忘記服藥，或者1~2天后基本消失而停服，影響療效或復發。此時不要急於改換藥物。
4、由於目前有多達45%的淋病患者在感染淋球菌的同時也感染衣原體和支原體，因此，在治療淋病時，可採取同時治療非淋菌性尿道炎聯合方案。
5、性伴侶如有感染應同時治療。經治療，病人的症狀持續存在，或症狀消失後又復發，最可能的原因是性伴侶未經治療。未經治癒與性伴侶性交，病菌由未經治療的性伴侶再次傳給患者。須知有40%的非淋菌性尿道炎患者是沒有任何症狀。所以不但患者本身要治療，其性伴侶也應接受預防性的藥物治療。方法與患者相同，如爲孕婦，可用紅黴素或阿莫西林治療。
6、對於已經多所醫院治療而未愈的患者。要詳細瞭解病情和療程，若按正規療法而無好轉或無效者，應改換另一種方法，甚至聯合治療。聯合治療時一般不要用同類抗生素。
7、若證實爲沙眼衣原體尿道炎患者，再次治療時把療程延長到4—6周可效。
8、已有不少報告分解尿素支原體對四環素有耐藥性，若疑屬於這種情況，則及時用其他抗生素。
9、如果患者反覆發作，應警惕併發症，如前列腺炎等，應做相應的細菌學查，並及時治療。
10、有條件的醫療單位，應對每一患者尤其是復發者做詳細的臨牀和細菌查，並進行鍼對性的治療，這樣才能徹底治癒。
11、臨牀表現與非淋菌性尿道炎的症狀不相符合，且化驗沒有查出病原體，考慮是否爲神經過敏症，此時要解釋、安慰並使用鎮靜藥物，經臨牀應用博樂欣效果較好。
12、若爲滴蟲、黴菌或其他少見病，尤其是黴菌性尿道炎，不能一味加用素，否則對患者危害更大，應查清後對症治療。
13、非淋菌性尿道炎治療時不應濫用抗生素，如絕大多數青黴素藥物對衣原體、支原體均無效，一般不應使用。磺胺對衣原體有效而對支原體均無效，鏈黴素大觀黴素對衣原體無效對支原體有效，慶大黴素、新黴素、多粘菌素對衣原體無效。
