藥物治療是強直性脊柱炎常用治療方法之一，有較好的療效。
1.非甾體抗炎藥：這類藥物可迅速改善患者腰髖背部疼痛和發僵的症狀，也可減輕關節疼痛並增加活動範圍，是治療強直性脊柱炎的首選藥;吲哚美辛栓劑50mg或100mg塞入肛門，每日1~2次;阿西美辛90mg，每日1次;塞來昔布200mg，每日2次;美洛昔康15mg，每日1次。
2.柳氮磺吡啶：此藥可改善患者的關節疼痛、腫脹和發僵的症狀，適用於強直性脊柱炎患者的外周關節炎;通常推薦用藥量爲每日2.0g，分2~3次口服。爲了增加患者的耐受性，開始用藥量爲0.25g，每日3次，以後每週遞增0.25g，直至1.0g，每日2次;通常選用一種起效快的抗炎藥與其合用，以達到更好治療效果。
3.甲氨蝶呤：此藥對外周關節炎、腰背痛、發僵等症狀有一定的治療效果;7.5~15mg，口服或注射，每週1次。
4.來氟米特：本藥對強直性脊柱炎患者的外周關節炎有較好的療效;通常以10mg/d的劑量使用，病情較重者可加至20mg/d。
5.糖皮質激素：甲潑尼龍15mg/kg/d衝擊治療，連續3天，可暫時緩解疼痛;對其他治療不能控制的下背痛，可在CT指導下行糖皮質激素骶髂關節注射，療效可維持3個月左右。
6.沙利度胺：初始劑量爲50mg/d，每7~10天遞增50mg，至150mg~200mg維持。
