根據陰陽學說外爲陽、內爲陰，上爲陽、下爲陰的規律，則人之體表在外爲陽，臟腑在內爲陰；頭在上爲陽，足在下爲陰；背在上外爲陽，腹在下內爲陰。
陰陽與人體生理的關係
無論是人體的整體還是各部分的生理功能，都可以用陰陽來概括說明。人體的正常生命活動健康與否，都決定於陰陽是否調和。人體的生理功能都是通過氣機的升降出入實現的，而陽主升，陰主降；陽主出，陰主入，人體之陰陽調和則氣機升降出入協調平衡，人體就健康，中醫稱爲“陰平陽祕，精神乃治”。
陰陽與人體病理的關係
人體陰陽失去平衡稱爲陰陽失調。陰陽失調後就會表現出各種症狀，古人對症狀的分類，也是用陰陽來代表和說明的。陽證，一般表現的症狀是：發熱、口渴、脈數（快）等，這類症狀，古人又稱爲熱（陽）證。陰證，一般表現的症狀是：不發熱、口不渴、手足冷、脈遲（慢）等，這類症狀，古人又稱爲寒（陰）證。這就是中醫所說的“陽勝則熱，陰勝則寒”。
臨牀上還有一類陰陽失調關係是陰陽偏衰。即是指陰或陽低於正常水平的失調，其一方低於正常水平，而另一方保持正常水平，或雙方都不同程度低於正常水平，故出現虛證。陰不足，陽相對偏盛則陰虛生內熱；陽不足，陰相對偏盛則陽虛生外寒；陰陽雙方都不同程度不足，則虛寒、虛熱並見或陰陽兩虛。這就是中醫所說的“陰虛生內熱，陽虛生外寒”、“陰陽兩虛”。
陰陽在診斷上的應用
陰陽是診斷的總綱。疾病雖然很多，但其病變部位、性質及證候的屬性都可以用陰陽來概括，如從疾病發展部位來看，不在表（陽），就在裏（陰）。從疾病性質來看：熱證（陽），寒證（陰）。從疾病發展趨勢來自看：實證（陽）虛證（陰）。在臨牀辨證中，首先要分清陰陽，才能抓住疾病的本質，做到執簡馭繁。
陰陽在治療上的應用
中藥種類甚多，但就其性能不外陰陽兩類，從藥性來看，不外寒、熱、溫、涼四性，其中溫熱屬陽，寒涼屬陰。其治療原則是“調整陰陽，以平爲期”，針對陰陽盛衰，採取補其不足，瀉其有餘，使陰陽偏盛偏衰的異常現象得到糾正，恢復其相對平衡狀態。
中醫常用“寒者熱之，熱者寒之，實者瀉之，虛者補之”的治療原則，促使失調的陰陽重新恢復到相對的平衡。臨牀上借藥性之偏，來糾正人體陰陽之偏，使達到“陰平陽祕，精神乃治”。臨牀具體用法：
1.陰盛則寒，治法：寒者熱之（用熱藥治療實寒證）；
2.陽盛則熱，治法：熱者寒之（用寒藥治療實熱證）；
3.陽不足、陰偏亢，治法：助陽抑陰；
4.陰不足、陽偏亢，治法：滋陰抑陽；
5.陰陽兩者均不足，治法：滋陰助陽（陰陽雙補）。
