一般醫生會在嚴格掌握和了解病情之後，根據適應證和禁忌證的要求來決定的。主要適應證有：
1、不明原因的血尿，排除爲非腎小球源性血尿。
2、不明原因而持續的蛋白尿。
3、考慮爲遺傳性腎炎。
4、考慮爲瀰漫性病變，如各型腎小球腎炎、腎病綜合徵、全身性疾病如系統性紅斑狼瘡、過敏性紫癜等引起的腎臟損害。
5、腎功能不全者，尤其急性起病，疑爲急進性腎炎時，應及早進行腎穿刺活檢。
6、腎移植術後等。這些均爲腎活檢指徵。
總之，兒童腎穿刺活檢還是相對安全，只要認真做好術前準備、掌握好適應證，術後認真調理。但是腎活檢會給腎臟帶來新的創傷，所以建議在可能的情況下兒童儘量不要做腎穿刺。
