一種觀點認爲，人工流產損傷了子宮內膜基底層，從而使子宮內膜無法再生。甚至造成永久閉經和終身不孕。
另一種假說則認爲，人工流產之後的閉經是與人體激素調節有關，與哺乳期不來月經的原理相似：
孕酮是孕激素的一種，是人體天然分泌的孕激素。孕激素具有負反饋的調節作用，自身能夠抑制自身分泌，而且也能夠抑制雌激素的分泌。在正常未孕女性的整個月經週期裏，排卵前的孕激素水平最低，排卵後開始上升，在黃體期爲最高。排卵前，體液中的孕酮水平應當低於2納克/毫升 ，排卵後則應當高於5納克/毫升 。而如果懷孕，孕激素水平剛開始會停留在黃體期的水平，而當胎盤形成之後，胎盤所分泌的激素就會使孕婦體內的孕酮水平上升到100-200納克/毫升，爲未孕女性的幾十倍到上百倍。因此得名孕酮。而由於孕激素的負反饋調節作用，當分娩之後，胎盤娩出，產後的婦女失去了胎盤這個激素源，體內的孕激素水平和雌激素水平就會驟然下降，導致哺乳期的婦女出現生理性的正常閉經。
而當人工流產之後，女性一下子失去了由胎盤供應的大量激素，導致體內的孕激素水平和雌激素水平驟然下降。故人工流產後的女性體內的孕激素水平和雌激素水平都會在一段時間內過低，導致暫時閉經。
