引起女性月經性陰道炎是因爲陰道的環境經常受到宿主的代謝產物、細菌本身的產物及外源性因素而不穩定。病原體有2種來源，即來自原本寄生於陰道內的菌羣和來自外界入侵的病原體。
內部原因
陰道菌羣非常複雜，除原蟲、真菌外，尚包括很多需氧菌及厭氧菌，這些微生物可分爲共棲的及病理性的，都生長在一個共同的環境內，各微生物之間可能有拮抗作用；另一個影響其生長的是氫離子濃度，在pH3.8～4.2時，有利於共棲菌的繁殖，尤其是乳酸桿菌，這是健康陰道中的主要菌種，當月經來時，這種平衡被破壞，互相制約作用消失，所以氫離子濃度下降，乳酸桿菌失去優勢，病理菌得以繁殖，就產生陰道炎的症狀。
外部原因
月經期內分泌激素髮生變化，破壞了陰道的生態平衡時，這些常住的菌羣會變成致病菌，衝破陰道屏障而引起感染；女性經期沒有經常換衛生巾或者衛生巾質量不佳也會會造成月經性陰道炎；女性在月經期間不注意個人衛生，或經期進行性行爲，或經期進行坐浴等，也會導致陰部受到污染，進而出現炎症。
