祝姓主要有三大起源，一是源自祁姓，西周時期，周武王賜封堯帝的後裔於祝地，後來以國和地爲姓，後裔便改爲了祝姓。二是源自任姓，顓頊的孫子重黎由於擔任火正這一官職，又被稱爲祝融氏，所以後代以祝爲姓。三是源自古代祭司官位，又稱爲巫祝，最終簡化爲祝姓。
祝姓起源和來歷1. 源自祁姓
在西周時期，周武王姬在平定戰亂之後，爲了表彰先聖，於是將黃帝、堯帝等先人的後裔都進行了分封，其中堯帝的後裔被封於祝地，也就是現在的山東禹城，最終成立了祝柯國，後來被齊國所滅，最終遺民便以祝柯氏爲姓，後來簡化爲祝姓，並且傳承給了後代。
2. 源自任姓
這也是祝姓最爲古老的一支起源，最早可以追溯到黃帝后裔顓頊的孫子重黎，他當時擔任部落中的“火正”一職，主要負責掌管部落中的火，帝嚳認爲他勞苦功高，就像火一樣發光融化天下，所以將其稱爲祝融氏，最終重黎的後代也就以祝融氏爲姓，現代時簡化爲祝姓。
3. 源自古代祭祀官職
祝姓也有部分族人是因爲祖先擔任祭司官職“巫祝”，才以“祝師氏”“巫史氏”“巫祝氏”等爲姓，最終也在多省文中被簡化爲了單字祝姓，最終形成了祝姓氏族的一脈。
4. 源自少數民族改姓
與趙姓起源和來歷類似，祝姓氏族中也有部分是由少數民族改姓而來，其中包括了鮮卑族、滿族、蒙古族以及回族等，最爲典型的就是鮮卑族中的拓跋部，其中有一個叫做吐缶氏的族羣，後來在北魏孝文帝在位的時候，因爲推行漢化政策而改姓爲祝。還有滿族中的喜塔喇氏後來也改爲了祝姓，不過滿族都是在清朝中期才改漢姓的。
