腎臟是系統性紅斑狼瘡損害最多的一個臟器，其損害可以出現在本病的任何階段，多發生在病程的1~2年內，隨着病程的遷延而增多，有的以腎炎形式開始發病，以後纔出現多系統的症狀，臨牀上腎外表現與腎臟損害不一定是平行關係，狼瘡活動可以沒有腎損害，但嚴重的腎損害多見於活動性狼瘡。狼瘡腎會給患者帶來嚴重的後果，因此要控制狼瘡病情，延長患者生命，提高生活質量，及時發現腎損害並儘早治療是非常重要的。狼瘡腎的早期可以無症狀或僅有乏力、腰部不適，經化驗尿中可出現紅細胞、白細胞、蛋白質和管型，腎功能早期正常，晚期多有改變，並且可發展成尿毒症，根據狼瘡腎的表現結合全身情況中醫把其分成腎陰虧虛型、脾胃兩虛型、腎虛瘀滯和溼熱蘊毒型，如持續尿蛋白，腰痠、五心煩熱，或自覺內熱，脈細數者，爲腎陰虧虛，治以滋陰補腎之法，選用六味地黃丸和相應的爲化中藥外敷滲透治療，主要藥物有地黃、山藥、山萸肉、丹皮、茯苓、澤瀉等，經研究本方能夠調整機體的免疫功能，降低尿蛋白；如疲乏無力、面色不華、下肢浮腫、腰痠、蛋白尿時間較長者，爲脾腎兩虛，治應健脾益腎，選用對症的微化中藥方劑外敷滲透或口服春澤湯加味，主要藥物有黃芪、黨蔘、茯苓、甘草、豬苓、澤瀉等；尿蛋白伴有潛血，肢體瘀斑，局部紅斑者，是腎虛血瘀所致，治以補腎活血，選用知柏地黃丸加桃紅四物湯口服或用起效較快的微化中藥方劑外敷，主要藥物用細生地、丹皮、桃仁、紅花、丹蔘、當歸、川芎、黃柏、知母等；如尿有蛋白、紅細胞、白細胞、腰痠腰痛、發熱、心煩、浮腫、舌苔黃膩脈滑數，是溼熱內聚，化熱成毒的表現，治療上利溼清熱解毒，用五苓散加味或採用相應的微化中藥方劑，主要藥物有豬苓、茯苓、澤瀉、白朮、馬鞭草、六月雪、苦蔘、赤小豆等。臨牀有些藥物能夠降尿蛋白，治療狼瘡腎，在各種症型均可選用如黃芪、白花蛇舌草、六月雪、蟬衣、芡實、落得打、意苡仁、連須、鬼箭羽、仙靈脾等。
狼瘡性腎炎是狼瘡活動損傷的一部分，隨着對狼瘡的全面治療，尿蛋白一起好轉，也有部分患者全身病情好轉後留有頑固性蛋白尿，這些患者堅持外敷或服用中藥較長時間，才能使尿蛋白好轉，不可短期服用後仍有尿蛋白就停用中藥，使治療效果降低。以上所列藥物在治療狼瘡腎的同時，對其它的臟器也有強壯作用，長期服用中藥的患者，最早的感受是精神振作，體力恢復，感冒減少，疲乏等症狀消失，蛋白尿在不知不覺中消失，在病情取得穩定的基礎上，將激素逐漸遞
