抑鬱症屬功能性疾病,通常實驗室檢查可有尿(五羥色胺)派出減少及腦脊液五羥色胺含量減低。但臨牀上需排除因腦炎、腦腫瘤、腦血管病、帕金森病所伴發的抑鬱情緒;同時需排除軀體疾病所伴發的抑鬱情緒,如甲狀腺功能低下,慢性肝炎、系統性紅斑狼瘡等。