胎心與母親之間存在胎壁屏障，藥物通過胎壁屏障才進入胎兒體內，從而產生藥物反應，因爲有些藥物可以通過胎壁屏障，對胎兒有致畸作用，因此，用藥應謹慎，大部分藥物在妊娠期的作用與非妊娠期相同，但由於妊娠期血容量以及肝臟代謝的不同，有些藥物會更加敏感。
孕早期（胚胎期），尤其是停經5周-10周，藥物對胚胎的影響最大，同一種藥，相對而言孕晚期用藥比孕早期用藥影響略小，但個別藥物在孕晚期仍不宜使用。用藥原則：儘量少用藥，如需要應在醫生指導下用藥。對於一些孕期常見的疾病，孕婦可以在醫生指導下合理用藥：
1、感冒
感冒是孕婦孕期比較常見的疾病，孕婦感冒後應根據症狀決定用藥，注意休息，均衡營養，多飲水，不去公共場所，適當鍛鍊，增加免疫力。
2、腹瀉
孕期腹瀉會引起孕婦脫水、電解質紊亂，影響營養物質的吸收，影響胎兒的生長發育，嚴重時還會流產或早產。孕婦若是腹瀉，首先要了解腹瀉原因，若爲感染性腹瀉，應用抗生素治療，無論如何，若腹瀉嚴重，則應看醫生，在醫生指導下補液並糾正電解質紊亂。
3、貧血
有些孕婦在懷孕期間會出現貧血、血糖異常等情況，貧血應瞭解何種原因，若缺鐵性貧血，輕者給予鐵劑口服，重者則給予鐵劑注射，必要時輸血，若爲鉅細胞性貧血，則檢查原因，對症處理。出現血糖異常，應做糖耐量實驗等檢查，瞭解是妊娠期糖尿病還是糖尿病合併妊娠，可給予飲食、運動、血糖控制不好應予以胰島素治療。
目前我國對孕婦的用藥借用了美國藥物和食品管理局制定的標準，按藥物的不同危害分級如下：
A級藥物：對孕婦安全，對胚胎、胎兒無害，如適量維生素A、維生素C、維生素D、維生素E等。
B級藥物：對孕婦比較安全，對胎兒基本無危害，如青黴素、紅黴素、地高辛、胰島素等。
C級藥物：僅在動物實驗研究時證明對胎兒致畸或可殺死胚胎，未在人類研究中證實，孕婦用藥需要權衡利弊，確認利大於弊時方能應用，如慶大黴素、異丙嗪、異煙肼等。
D級藥物：對胎兒危害有確切證據，除非孕婦用藥後有絕對效果，否則不考慮應用，如硫酸鏈黴素（使胎兒第8對腦神經受損、聽力減退等）、鹽酸四環素（使胎兒發生齶裂、無腦兒等）等要在萬不得已時才使用。
X級藥物：可使胎兒異常，在妊娠期間禁止使用，如甲氨蝶吟（可致胎兒脣裂、齶裂、無腦兒、腦積水、腦膜膨出等）、乙烯雌酚（可致陰道腺病、陰道透明細胞癌）等。
妊娠前3個月，以不用C、D、X級藥物爲好。出現僅僅情況必須用藥時，也應儘量選用確經臨牀多年驗證無致畸作用的A、B級藥物。
1、懷孕就診要注意月經期。應告訴醫生自己已懷孕和妊娠時間；有受孕可能時，用藥需要注意月經是否過期。
2、不能自行用藥。準媽媽的疾病同樣會影響胎兒，因此既不能濫用藥物，也不能有病不用。不能自選自用藥物，一定要在醫生的指導下使用已證明對胚胎與胎兒無害的藥物。
3、可用可不用的藥物應儘量不用或少用。尤其是在妊娠的前3個月，能不用的藥或暫時可停用的藥物，應考慮不用或暫停使用。
4、用藥必須注意孕周，嚴格掌握劑量、持續時間。
5、堅持合理用藥，並且控制後及時停藥。
6、兩種以上的藥物或有相同或相似的療效時，應考慮選用對胎兒危害較小的藥物。有A、B類藥物可用，則應選用A類藥。在無A、B類藥可用選時，慎用C類藥。D類藥只有無其他藥物可選用且準媽媽病重急需用藥時才選用。對於未經動物實驗以及臨牀資料報道證實有無危害的藥物儘量不用。因爲無資料證實不等於沒有危險。
7、肯定的致畸藥物禁用。
8、能單獨用藥就避免聯合用藥，能用結論比較肯定的藥物就不用比較新的藥物。
9、孕期禁用試驗性用藥，包括妊娠試驗用藥。
