根據ECFA，雙方同意將兩岸醫藥衛生合作列爲下半年第六輪會談協商議題並簽署協議。預計接下來的會談將採取先易後難、先主後次的方式來展開。
在ECFA簽署後的第三天，2010年廣西臺灣醫藥衛生合作懇談會在臺北舉行。會上，兩地簽署了鹿角靈芝開發和利用、心腦血管醫療技術和藥物技術開發等14個項目的合作協議。在此之前，致力於中醫應用基礎研究、中醫臨牀研究等領域合作的海峽兩岸中醫藥科研平臺項目在廈門高調啓動。
種種跡象表明，兩岸在醫藥合作上已駛入快車道。
中藥產業合作受阻
“其中，傳統中醫藥合作必是重中之重。我認爲，科研合作將是兩岸下一階段的重點，尤其是制訂通用的藥材標準時不我待。”李時珍藥業總經理林朝輝如是說。
林朝輝同時也表示，目前兩岸醫藥產業的合作範圍偏窄，且層次欠深。他建議，兩岸應突破法規障礙，聯合開展中藥成分機理的研究，把合作重點放在附加值高的藥品上，共同探討兩岸互認標準和相關技術的合作。
據瞭解，2009年臺灣經濟主管部門在公佈開放中國大陸赴臺投資的開放項目中，將中藥業排除在外。分析人士由此認爲，這對中國大陸的中成藥造成一定限制，相對而言，重點突破的難度不小。數據顯示，目前臺灣地區所用的中藥材有95%來自大陸，兩岸每年的中藥材貿易額接近100億元人民幣。
呼籲無縫對接
兩岸醫藥衛生合作的銜接難題越來越受到行業的關注。與ECFA同一天簽署的《海峽兩岸知識產權保護合作協議》，爲兩岸深入合作從產權方面實現對接打開了一扇窗。
廣州一家制藥企業相關人士分析指出，某種意義上說，這是在爲下半年醫藥衛生合作的談判鋪路架橋，同時也是規範兩岸研製秩序、促進聯合創新的有力措施。
“兩岸醫藥衛生全面合作，制度銜接是根本，也是最核心的關鍵，以上對接的落腳點仍在於制度的銜接。因此，探尋兩岸合作對接需要循序漸進，先易後難，繼續適度放寬政策，把步子邁得更大一些。”業內人士如是認爲。
