现在大多数慢乙肝患者是儿时就感染乙肝病毒所致，这种感染可发生在胎内，常见于分娩过程中，也可于产后3年内。
由于婴幼儿的免疫系统尚不成熟，乙肝病毒感染肝细胞后机体不能识别，认敌为友而容忍其在机体中存在并复制，这种现象医学上称免疫耐受，导致病毒在肝细胞内长期存在和复制。
被病毒感染的肝细胞可占肝细胞总数的10%~40%，而且新生的肝细胞又可再被病毒感染，如此，虽然机体成年后免疫系统完备，但要彻底清除这些病毒已做不到。
病毒“寄生”于肝细胞内，每次清除反应(即肝炎活动)使部分肝细胞破坏，乙肝病毒被部分清除，病毒复制模板也被部分清除，但是总是不彻底，且可出现新生的肝细胞再感染，周而复始持续几十年乃至终生。
核苷类药物的作用主要是通过阻断乙肝病毒的DNA的复制而起到治疗的作用，并不能清除乙肝病毒复制的模板，所以核苷类药物的治疗必须长期服药。
核苷(酸)类似物核的停药标准
1、HBeAg(+)慢性乙肝患者，在间隔至少6个月的两次检查中，均出现HBeAg血清学转换和HBV DNA检测阴性，可终止治疗。
2、HBeAg(-)慢性乙肝患者，有相应的改变HBV DNA低于检测下限，ALT正常后，至少再巩固1年半(经过至少三次复查，每次间隔6个月)仍保持不变，且总疗程至少达到2年半者，可以考虑停药。由于停药复发率较高，可以延长疗程。
