就人工流產本身來說，雖然是個相對安全、簡便的小手術，但並非沒有危險。人工流產術常見的危險除手術過程中可能發生子宮穿孔、大出血、人流綜合徵等意外併發症外，術後仍有發生以下併發症的危險。
一、感染
以急性子宮內膜炎居多，也發生輸卵管炎、盆腔結締組織炎和腹膜炎。一旦患了輸卵管炎，輸卵管黏膜受損、管腔變窄，甚至管腔堵塞，便可因此而喪失生育能力或發生宮外孕。
二、宮頸或宮腔粘連
人工流產術時因吸宮負壓過高、吸宮時間過長，宮腔受到過度搔刮，手術器械反覆進出宮口等引起宮頸管及宮腔內膜損傷，發生宮頸或宮腔粘連，表現爲人流術後閉經或月經過多，週期性下腹痛，從而繼發不孕。
三、月經失調
少數婦女在人流術後出現月經不規則，經期延長，不能恢復每月一次的排卵功能，可引起不孕。
四、子宮內膜異位症
人流術時吸宮負壓突然降低，使蛻膜碎片隨宮腔血水倒流入盆腔，並種植發展成子宮內膜異位症，表現爲繼發性痛經進行性加重，形成不孕。
五、再次妊娠可能有不良後果
人流術可能造成子宮內膜損傷或炎症。再次妊娠後因蛻膜發育不良，可發生胎盤粘連、植入、前置等異常，因此而發生產前、產後出血、早產、死胎、死產、產後感染等機會均明顯高於無人流史的孕婦。此外，Rh陰性血型婦女初孕人流後再次妊娠時，因母兒Rh血型不合造成流產、死胎、新生兒溶血而死亡。
