原因一 由於1—2週歲的寶寶來說，生長發育特別迅速，所以身體需要的營養及熱能較多。然而消化器官卻未完全發育成熟，分泌的消化酶較少。因此寶寶的消化能力較弱，所以容易發生腹瀉。
原因二 由於寶寶的神經系統對胃腸的調節功能差，所以如果飲食稍有改變就容易發生腹瀉。例如：對添加的離乳食品不適應、短時間添加的種類太多、一次喂得太多、突然斷奶、飲食不當、如吃了不易消化的蛋白質食物。氣溫低身體受涼加快了腸蠕動、天太熱，消化液分泌減少及秋天溫差大、小肚子易受涼等，這些都有可能會寶寶發生腹瀉。
原因三 由於寶寶的胃腸道免疫力較低，所以只要食物或食具稍有污染，便可能會引起腹瀉。加上因爲抵抗力較低，容易引發呼吸道感染，在患感冒、肺炎、中耳炎時，也可能引起腹瀉。
