在長江三峽大壩工程開工時期，長江沿岸許多地方變成庫區，一切將被淹沒。三峽邊的一個信號臺上，有一個叫麥強的人。他性格內向，30歲了還過着單身生活。信號臺的生活很單調，但他似乎已經習慣了。麥強的朋友馬兵認爲生活中沒有女人不行，就給他帶來了麗麗，但是麥強對麗麗不感興趣，他經常做一個同樣的夢，夢中有一個女人向他微笑。麥強與麗麗單獨在一起一個晚上，但是並沒有幹什麼。陳青是三峽邊上一個小旅社的服務員，年紀輕輕死了丈夫，一人帶着兒子苦度時光。她工作不順心，有時還受顧客的氣，而經理老莫自以爲是陳青的守護神，經常照顧她，向她獻殷勤。然而這一切都不能令她愉快，她總是一個人對着江水發呆。她想離開這裏，擺脫老莫。她似乎總聽到有個聲音在召喚她。
一天，一個人酒後偶然的一句玩笑話，使這兩個順着各自的軌道生活的人意外地相遇了。麥強驚喜地發現陳青就是他夢中的人。麥強和她睡了覺，還留下了身上所有的錢。老莫把這件事理解爲強姦並告到派出所。正準備結婚的警察吳剛負責調查這個案子。麥強被關了，但陳青最終卻告訴警察吳剛說她不是被迫的。問題的性質改變了，這成了陳青的作風問題。麥強被放了，從此陳青成了衆矢之的，她的日子比以前更難熬了。一天，麥強從馬兵口中得知自己給陳青帶來的痛苦，他再也不能平靜地呆在自己工作的信號臺，他毅然橫遊長江，不顧一切地來到了陳青身邊……
章明說：“電影是一個一個的夢。離開了幻想，電影還能表現什麼呢？如果不做夢，生命還有何期待？”如果你要做夢，那你首先需要一張牀。如果把《巫山雲雨》中麥強、陳青等人的故事說成是一個夢的話，那麼長江之濱的巫山小鎮就是那張生產夢境的牀，他也是章明電影的牀，只不過這張牀是一張即將坍塌的牀，因爲巫山小鎮上所有人都知道這是一座即將被大水淹沒的城市，因爲無論是在江水邊的石崖、還是在小鎮裏的高樓上，那一條條的白色的水位線都表明了這一點。這一切意味着這座城市裏所有的故事、記憶也許還有某些未解之謎都將在不久的某一時刻永沉水底。這是一張不安的牀，所以這張牀產生的夢也是充滿了焦慮，當然，夢也直接暴露了他們焦慮的原因：期待。但是就是在這樣一座即將消失的城市，人們仍然在生活，仍然在奔忙，仍然在雞零狗碎，仍然在勾心鬥角，仍然在是是非非，吳剛這個影片中最現實的人物仍然在忙着裝修房子、運冰箱、聯繫塗料，仍然在要求打戒指的老頭：“窄一點，再窄一點。”他的這樣一種認真態度出現在了這樣一座即將消失的城市上，呈現了一種頗爲有趣的人物狀態，我們不禁會問：何必呢，一切都即將走向終結。其實不光是巫山小鎮的人們，整個人類一直也都是如此。福克納說：“到處都同樣是一場不知道通往何處的越野賽跑。”而在《我彌留之際》中，本德倫一家歷盡千辛萬苦付出了沉重的代價目的只是爲了要給一個死人艾迪去下葬，同樣的荒誕確實讓我感到這部小說同《巫山雲雨》中的某些感覺有種暗合的味道。小說中艾迪·本德倫的父親告訴她：活着的理由就是爲了長期的死做好準備。如果說活着就是爲了死亡，那麼也許存在就是爲了消失，一個小鎮從建立到消失，多像人類的一生，在一生中你不停地奔忙，可最終塵歸塵、土歸土，和在今天已經被大水淹沒的巫山小鎮有什麼分別？可是，期待，在期待之中。人們有了期待，這恐怕就是人們存在動力，至於什麼是有意義的，什麼是沒有意義的，好像並不是那麼重要了。如果提這樣一個問題：如果一切馬上都將結束，那我們此刻應當怎樣生活。也許得到最多的真實答案是：還這麼活。
