肾结石的病因很多，有遗传性因素、代谢性因素、感染性因素、环境因素、饮食因素、解剖因素、药物因素等等。
1.肾结石形成的有关因素：尿液中的某些晶体与胶体沉积聚集形成结石，不同部位和不同成分的结石其形成的因素不尽相同。有些与地域、水质、饮食习惯、缺乏蛋白质和含硫氨基酸的营养不良、维生素A缺乏等外在因素有关，有些则与内在因素有关，如遗传倾向、代谢特点变异、慢性腹泻、甲状旁腺功能亢进、尿路畸形、梗阻、感染、异物、瘘道及尿液酸碱度变化等。
2.肾结石的性质：近年来应用矿物学和晶体学对结石进行成分分析，了解到绝大多数尿石成分是混合性的，但以某一种为主，由磷酸钙及草酸钙组成的约占65%，磷酸镁胺约占15%.其余20%为尿酸、胱氨酸及黄嘌呤。草酸盐结石可在酸性或碱性尿中形成，深褐色，质硬，表面常有小棘突状结构形如桑椹。尿酸盐结石黄褐色，在酸性尿中形成。磷酸盐结石色较白、质软脆表面粗糙，在碱性尿中形成。在肾盂中形成的结石，可呈肾盂肾盏的形态，称为鹿角形或铸形结石。
