近年來核苷(酸)類似物治療慢性乙型肝炎的臨牀研究進展迅速。
研究涉及的病人數量多，範圍廣，包括不同區域和人種，持續時間長，有的研究已經有長達10年的結果。研究的對象包括HBeAg陽性和HBeAg陰性患者，代償性和失代償性肝硬化患者，接受化療或免疫抑制劑治療的患者，肝移植患者等。研究方法科學、客觀。核苷(酸)類似物作用於病毒逆轉錄酶，直接抑制病毒複製，
核苷類似物的優點是：具有起效快、作用強、口服方便、不良反應少等特點。
缺點是：由於難以徹底清除病毒，需要長期用藥，但在長期用藥的過程中可能發生耐藥突變，且耐藥率逐年升高。總體來說，經核苷(酸)類似物治療後患者的血清HBV DNA水平迅速下降，部分患者可降至檢測範圍以下(PCR法)，ALT水平下降或復常，HBeAg陽性的部分患者出現HBeAg陰轉或血清轉換，肝組織學炎症或纖維化指數改善。長期治療和耐藥突變監測是成功治療的關鍵。
同干擾素相比較，核苷(酸)類似物具有以下優點：(1)起效迅速，能在較短時間內抑制HBV複製，達到血清HBV DNA測不到的水平。(2)口服給藥，服用方便，不受時間、地點的限制;而干擾素需要注射，還需要低溫保存(冰箱冷藏)，如果經常出差就很難應用了。(3)副作用極少，具有良好的耐受性，即使晚期肝硬化患者也能安全使用。(4)價格比干擾素便宜，治療期間的花費比干擾素少得多。但是核苷(酸)類似物僅能抑制乙肝病毒複製而不是殺滅病毒，停藥後容易復發，所以需要長期服用，沒有確定的療程。
再有，這類藥物可引起乙肝病毒耐藥變異，一旦出現耐藥就需要調整治療方案;如果出現多重耐藥，進一步治療就會非常棘手。核苷類似物治療乙肝的適應人羣較爲廣泛，如果是成年人，乙肝病毒複製指標陽性，肝功反覆異常即可使用，包括慢性乙肝、肝硬化和重症肝炎。但是核苷類似物具有不同程度的生殖毒性，所以育齡婦女和未婚女性應該慎重使用。
另外慢性腎炎、腎功有問題者，不宜選用阿德福韋。高強度體力勞動者不宜使用替比夫定。在美國和歐洲，因拉米夫定耐藥率較高，除了用於在化療或懷孕過程中需進行短期抗病毒預防治療的患者、HBV/HIV共同感染者外，不推薦作爲一線用藥。在亞太地區包括我國，拉米夫定抗病毒作用較強較快，價格低，安全性好，治療各種HBV相關病症的資料完整，目前仍然是抗HBV治療的一線用藥。阿德福韋酯耐藥發生率低，同其他核苷類藥物無交叉耐藥，與其他核苷類藥物聯合治療是目前耐藥病人的一種選擇。
抗病毒作用弱和腎毒性是其主要缺點，在歐美替諾夫韋已逐步替代了阿德福韋酯。恩替卡韋抑制HBVDNA作用強而迅速，而且耐藥率在四種核苷(酸)類藥物中最低，比較適用於病毒載量高急需快速抑制的核苷初治病人，拉米夫定耐藥後選擇恩替卡韋，不僅劑量要加倍，還容易發生耐藥，因此不是拉米夫定或替比夫定耐藥的理想選擇。 替比夫定抑制病毒效能優於拉米夫定，耐藥率低於拉米夫定，但高於恩替卡韋和阿德福韋酯，與拉米夫定有交叉耐藥(YMDD)，治療過程中要監測肌酸激酶(CK)，不建議與干擾素聯合應用。
