儘管試管嬰兒爲不孕不育患者帶來了福音，但它並不是萬能的，它也有其適應證，並非人人可做。歸結起來，其適用的情況主要有以下六種：
①雙側輸卵管不通：因輸卵管是卵子和精子固定的約會結合地點，道路不通，精卵無法相遇，只有採用試管嬰兒技術幫助他們結合。但是，有些輸卵管疾病應該先嚐試治療，比如輸卵管間質部阻塞，採用宮腔鏡下插管注藥效果很好，臨牀上治療一兩次就受孕的例子很多。而傘部粘連或積液的患者可以先行腹腔鏡下粘連鬆解或造口術，若經治療輸卵管仍不通暢，就要考慮做試管嬰兒了。
②子宮內膜異位症：患者的子宮內膜跑到子宮腔外生長，分泌一些毒性因子，嚴重者造成卵巢及輸卵管傘端粘連，可引起排卵、拾卵或精子在輸卵管內的運送障礙。若治療無效？薰可考慮採用試管嬰兒技術。
③免疫性不孕：不孕症中約１０％～２０％屬免疫性不孕，經治療無效，可考慮做試管嬰兒。
④女性排卵障礙：當下丘腦、垂體或卵巢發生病變時，都可造成卵泡無發育、發育不成熟或成熟後無排卵。當通過促排卵治療或其他治療方法，可以使卵巢發育出成熟卵泡時，就可以通過試管嬰兒技術體外取卵，輔助生殖。
⑤男性少精子症、弱精子症、畸形精子症患者：可以首先嚐試藥物治療及人工授精，若多次不受孕，應考慮行試管嬰兒。睾丸生精功能正常，但輸精管道阻塞，精子不能排出體外的無精子症患者，可以行睾丸或附睾穿刺取精，通過第二代技術即顯微單精子卵泡漿注射獲得妊娠。精子體外培養方法能使原先運動能力低下的精子一舉變成“運動健將”，提高精子質量，增加受孕的機會。
⑥不明原因的不孕：目前的檢查條件無法找到明確的病因，經其他治療方法不能成功受孕的患者。
這裏要提醒的是，患者只有遇到第一種情況，纔會在第一時間被告知做試管嬰兒。其他五種情況應首選其他簡單、經濟有效的治療方法，如藥物治療、人工授精等，當這些治療都行不通時，才建議做試管嬰兒。
另外，試管嬰兒的目的是幫助患者生育一個健康、聰明的孩子，但前提是不能威脅母親的健康。如果女方有心、肝、腎等重要臟器功能異常，不能耐受妊娠及分娩，或男女任何一方有嚴重遺傳性疾病等，都最好避免妊娠。另外，女方年齡過大時，也最好放棄妊娠，因爲年齡過大，卵子質量差，對促排卵藥物反應差，妊娠率低，而且流產率、胎兒畸形率及妊娠期合併症等都增加，若強行爲之，有時後果是很嚴重的。
