子宮內膜異位症一般能治好，但是複發率較高。
子宮內膜異位症可以在醫生的指導下服用相關藥物進行治療，常用藥物有布洛芬、吲哚美辛、萘普生、甲羥孕酮等。但要注意，除根治性手術外，通過藥物治療、保守性手術、半根治性手術等手段干預的患者，其存在着較高的複發率，所以建議患者遵醫囑定期複查，做好長期疾病管理。
對於子宮內膜異位症的復發，45歲以上無生育要求的重症患者可以選擇切除子宮、雙附件等病竈組織做根治性手術，從而達到徹底治癒的效果。
