卵巢囊腫在早期並無明顯的臨牀表現，患者往往因其他疾病就醫在行婦科檢查時才被發現。以後隨着腫瘤的生長，患者有所感覺，其症狀與體徵因腫瘤的性質、大小、發展、有無繼發變性或併發症而不同。
下腹不舒感爲患者未觸及下腹腫塊前的最初症狀。由於腫瘤本身的重量以及受腸蠕動及體位變動的影響，使腫瘤在盆腔內移動牽扯其蒂及骨盆漏斗韌帶，以致患者有下腹或骼窩部充脹、下墜感。
患者覺察自己的衣服或腰帶顯得緊小，方纔注意到腹部增大，或在晨間偶然感覺，因而自己按腹部而發現腹內有腫物，加之腹脹不適。
卵巢囊腫無併發症，極少疼痛。因此，卵巢瘤患者感覺腹痛，尤其突然發生多系瘤蒂發生扭轉，偶或爲腫瘤破裂、出血或感染所致。此外，惡性囊腫多引起腹痛、腿痛，疼痛往往使患者以急症就診。
一般卵巢，甚至雙側卵巢囊腫，由於並不破壞所有的正常卵巢組織，故多半不引起月經紊亂。有的子宮出血並不屬於內分泌性，或因卵巢瘤使盆腔的血管分佈改變，引起子宮內膜充血而起；或由於卵巢惡性腫瘤直接轉移至子宮內膜所致。因內分泌性腫瘤所發生的月經紊亂常合併其他分泌影響。
