肛瘻常有肛周膿腫自行潰破或切開排膿的病史，此後傷口經久不愈，成爲肛瘻外口。主要症狀是反覆自外口流出少量膿液，污染內褲；有時膿液刺激肛周皮膚，有瘙癢感。若外口暫時封閉，膿液積存，局部呈紅腫，則有脹痛，封閉的外口可再穿破，或在附近穿破形成另一新外口，如此反覆發作，可形成多個外口，相互溝通。如瘻管引流通暢，則局部無疼痛，僅有輕微發脹不適，病人常不介意。
常見症狀爲以下4點：
1、排膿：排膿是肛瘻的主要早期症狀。一般來說，新生成的瘻管排膿較多，膿汁粘稠，黃色、味臭；瘻管日久的排膿相對較少，或時有時無，稀淡如水；若膿量增加，則表示新瘻管生成。瘻管有時會暫時封閉，不排膿液，從而出現局部腫痛，體溫上升，以後封閉的瘻口破潰，又排出膿液，也可從瘻口排出氣體或糞便。
2、瘙癢：肛門部皮膚由於膿液及其他排出物刺激，膿液不斷刺激肛周皮膚，常感覺皮膚瘙癢。肛周潮溼不適，皮膚變色、表皮脫落，纖維組織增生和增厚，有時形成溼疹。
3、疼痛：瘻管通暢無炎症時，一般無疼痛，只有肛門局部略有腫脹感，行走時可加重，若外口封閉，瘻管存積膿液，或糞便進入瘻管，則會疼痛加重或排糞時疼痛加重，而內盲瘻則常感直腸下部和肛門部灼熱不適，排糞時疼痛加重。
4、硬結或瘢痕：由於瘻管壁及瘻口的反覆刺激，使纖維組織增生，在管壁和瘻口形成質韌的結締組織，常表現爲瘻管周圍皮膚變色，表皮脫落，凹陷變形，觸及條索狀硬結通向肛門內。
肛瘻一旦形成，就不可能自然癒合，必須要手術治療介入才能根治。對於肛瘻的治療，傳統的往往痛苦很大，且治療不徹底，極易復發，積極的診斷和治療最關鍵！
