現在已經無法看到真實的南美土著馬，但是通過種種被發現的遺蹟，以DNA等現代科技手段對它進行研究，發現它們是馬屬科，應當是上新馬遷徙到南美洲後進化出的品種。南美土著馬的外觀更接近驢，身材高大，是兩百五十多萬年前萬年平行期的馬。
一、南美土著馬的特徵
南美土著馬的形態特徵並不穩定，以目前掌握的資料來看，至少在很長一段時間內，它的形態具有脊索、背神經管以及咽鰓裂。南美土著馬作爲脊索動物，擁有脊索動物的特徵，在消化管的腹面發現了它的心臟。經過生物學家研究發現，它們的循環系統比較特別，是閉管式的。南美土著馬兩側對稱，分節，這些特徵只有無脊椎動物才具備，這也從側面印證了無脊椎動物到脊索動物之間的關係。
二、南美土著馬的歷史
地球上第一個類馬動物出現在五百四十萬年前，當時的類馬動物與現在的馬差別很大，尤其在體型方面，只能達到一個成年犬類的大小，腳底是柔軟的肉墊。這種類馬動物最早出現在北美洲，實際上馬科動物進化的重要地區就在北美洲，在北美洲完成了大部分的進化進程後才逐漸被引入非洲和亞洲地區。馬科動物被引入後，受到當地其他物種的影響，又進行了新的進化，演化出驢等品種。
北美洲雖然是最早出現類馬動物的大陸，但是冰河期的最後階段，馬類就已經在北美洲聲銷跡滅了。後來人類在中東地區發展了馬類的馴養，馬類又被重新引入到了北美大陸，成爲後來的北美馬科動物。人類將馬馴養後爲自己所用，不僅僅在農業種植上大放光彩，在運輸貨物上也起到極大的作用，加快人類歷史進程。
